229年，诸葛亮派遣陈式领兵攻打武都、阴平。魏国雍州刺史郭淮率领众军准备攻打陈式，诸葛亮亲自领兵进取建威，郭淮只得退守雍州，诸葛亮于是平定武都、阴平二郡。
后主刘禅下诏策封诸葛亮说：街亭一仗，主要罪责在于马谡，而您引罪自责，深深贬抑自己，当时难违您的心愿，只好同意自贬三级的请求，去年率兵扬我军威，斩杀王双；今年再次领兵出征，郭淮逃遁；招降安抚氐、羌各部，收复武都、阴平二郡，威风震慑凶敌，功勋昭著天下。现在天下尚未平定，元凶首恶仍未铲除，您肩负着重任，主持军国大政，长期贬损自己，极不利于弘扬先帝的伟大事业，现在恢复您的丞相职务，请您不要推辞。
231年，诸葛亮再次兵出祁山，用木牛运送物资，粮尽退军。与魏将张郃交战，张郃被蜀军射死。
234年春，诸葛亮统率全军从斜谷出兵，用流马作为运输工具，进军占据武功县五丈原，魏军主将司马懿与之对垒相持于渭南。诸葛亮常常担心粮草接济不上，而使自己志愿不得实现，于是将部队分作两部分，一部分就地开荒耕种，作为长期驻扎的基础。耕垦的兵卒杂居在渭河附近的百姓中间，百姓生活安定，军卒所种不谋私。
蜀、魏两军相持一百多天。当年八月，诸葛亮患疾逝于军中，年仅五十四岁。待蜀军撤走，司马懿一一巡视蜀军的驻扎营地，叹道：孔明真是天下奇才啊！
诸葛亮遗言命令部下将自己葬在汉中定军山，依山势修建坟墓，墓穴仅能容纳下棺材，穿平时的衣服入殓，不必用其他器物殉葬。
后主刘禅下诏祭奠诸葛亮说：您天生兼备文、武的才干，英明睿智忠厚诚实，受先帝托孤遗命，尽心力辅佐寡人，使衰微待绝的汉室复兴，立志平定天下战乱，整治六军，岁岁出战，英武盖世，威震天下，将为蜀汉建成伟大功业，所取勋绩有如伊尹、周公。为何有此不幸，大业即将功成，您却染疾归天！朕痛悼您的逝世，心肝欲裂。推崇您的德行，论评您的功勋，根据您生前事迹追封谥号，让您的精神传扬天下，英名永垂史册。现在特派持使节左中郎将杜琼，赠给您丞相武乡侯印绶，追谥您为忠武侯。英魂有知，对此亦感宠荣。悲痛至极！悲痛至极！
当初，诸葛亮曾向后主表明自己心愿：臣在成都有桑树八百棵，薄田十五顷，子孙们的日常衣食费用已有宽余。至于臣在外任职，没有额外的花费安排，随身衣服饮食全有国家供应，无需再治其他产业，来增添家财。待臣离开人世时，不让家有多余衣物，外有多余钱财，使自己辜负陛下的恩宠和信任。
及至去世，果如前言。诸葛亮天生擅长巧思，曾构思并指导改进弓弩使之连射，制造木牛流马作为运输工具；他推演兵法，设计八卦阵图，无不深得要领。他留世的议论、教令、书信、奏疏都很值得一读，另编成《诸葛氏集》。
263年春，后主刘禅诏令为诸葛亮在沔阳建立祠庙。当年秋天，魏国镇西将军钟会征伐蜀汉，到汉川县时，前去祭扫诸葛亮祠庙，下令军中士卒不得在诸葛亮墓附近牧马砍柴。诸葛亮的弟弟诸葛均，官至蜀长水校尉。诸葛亮的儿子诸葛瞻，继承了父亲的爵位。
臣陈寿等奏：诸葛亮辅佐衰弱之国，利用地势险阻终不归服，然而我大晋仍然保存他的文字材料，耻于对其嘉美文、言的记录有所遗漏，确实显示了我大晋光明无极的仁德，泽惠天下，自古以来，无与伦比。
诸葛亮年轻时就显露出超群才华、英雄气概，他身长八尺，容貌伟岸，当时的仁人志士都对他甚为看重。遭遇汉末动乱，他随叔父诸葛玄避难到荆州，亲身耕种田地，不求闻名显达。
当时左将军刘备认识到他有奇才，于是三顾茅庐亲自前往拜访；诸葛亮也深感刘备出类拔萃、英姿超群，于是推心置腹地向刘备显示忠诚，两人倾心相交。魏武帝南征荆州，刘琮献出荆州归降，刘备大势已去、兵力单薄，以致无立锥之地。
当时诸葛亮年仅二十七岁，即向刘备献上奇谋，亲身出使东吴拜见孙权，求东吴发兵救援刘备。孙权本来对刘备就钦服景仰，此时又见诸葛亮卓尔不凡，对他甚为敬重，当即派遣三万人马去救援刘备。
刘备借助东吴援军与魏武帝开战，将曹魏军队打得大败，并乘胜进军连打胜仗，于是平定了江南地区。后来刘备又西取益州。益州平定后，被任命为军师将军。刘备称帝，拜封诸葛亮为丞相，总管尚书台政务。
待刘备去世，其子刘禅继位，年少无知，政事无论大小，全由诸葛亮裁断。于是他对外与东吴连好结盟，对内平定南部诸郡，颁定法律制度，整治全国军队，所制机械极其精巧，法令严正赏罚分明，作恶者无人不受惩处，为善者无人不被表彰，终于使全国做到官吏不敢违法犯纪，人人奋求上进，道不拾遗，强不凌弱，民风淳厚，秩序井然。
处在当时社会，诸葛亮的理想是，进而如蛟龙举首猛虎雄视，一举而统一四海，退而割据边疆，壮大国力而震慑天下。他还考虑到自己去世后，则蜀国无人为继像自己一样进伐中原抗衡强魏。故此年年用兵不止，屡屡张扬武力。
然而诸葛亮的才干，长于整治训练军队，奇谋制敌方面却有所短缺。治理百姓之才干，强于他为将的谋略。况且与他对阵作战之人，不乏当代人杰。加上双方力量对比悬殊，本应采取守势的蜀国他却反而频频主攻，所以虽说年年兴师动众，却未能取得成功。
昔日萧何举荐韩信，管仲举荐王子城父，都是因为考虑到了自己的才能长于治国，未能兼有军事指挥的才干。诸葛亮的治国政治才干或许不亚于管仲、萧何，可惜他当时找不到城父、韩信那样的名将，致使自己的功业难成，统一的理想不能实现。可见天命所归，不是人的智慧能力可以争到的事。
234年春，诸葛亮率军出武功，分派兵卒开荒屯田，作为长久驻军的基础。这年秋天他就因病去世，百姓追忆怀念他，把他的功绩作为谈话的材料。
直到今天，梁州、益州的百姓赞述诸葛亮的话仍能听到，即使《甘棠》颂扬召公、郑人歌颂子产，也不可与此种情形相比。
孟子说过：用最终目的在于让百姓享受安乐的措施来役使百姓，即使劳苦人们也不会口出怨言；用最终目的在于使百姓幸福生存的手段来伤害性命，即使人被杀死他也不会心存忿恨。此言可信啊！
评论者有人认为诸葛亮文辞华彩不够，而过于口罗嗦详尽。臣则认为皋陶是大贤人，周公是大圣人，但考察《尚书》所载文字，其中‘皋陶谟’中皋陶之言简略典雅，‘周公诰’中周公之文繁复尽详，为什么他们也不一致呢？
因为皋陶在与舜、禹交谈，周公在同下属们一起发誓。诸葛亮所谈话的对象，尽是普通的士兵百姓，所以他不必追求华丽深奥的文辞。然而他的著作文字，都是他亲身经历事情或亲手处理事务的经验之谈，其公正诚实的精神跃然纸上，因此通过这些文字可知他的思想主张，对当今世事有着补益借鉴的价值。
伏首深思陛下效行古代圣贤，胸怀坦荡无所忌讳，所以即使是敌国肆意攻击的言辞，也都全部抄录而不加任何删改，以此传扬治理天下的道理。臣下谨慎地录写这些文字上交著作省。臣陈寿诚惶诚恐，叩头再叩头，罪该万死。274年，平阳侯相臣陈寿上。
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